美国国立卫生研究院宣布5-HTP“可能不安全”。美国国立卫生研究院在2010年更新中指出，没有足够的证据来支持许多主张，并且由于它可能造成的伤害，该机构建议人们在知道更多信息之前不要服用它。
天然药物综合数据库说，由于与EMS链接，因此5-HTP可能是不安全的，并建议不要使用它。FDA还警告需要谨慎。峰X与1991年一例服用5-HTP的EMS病例有关。1998年，Mayo诊所的研究人员测试了六批5-HTP，并在其中每一个中发现了少量的X峰-与导致EMS爆发的污染物相似。（FDA的最新测试也发现了污染物。）
经过分析的5-HTP补充剂所含的X峰的X值仅为色氨酸的3至15％，但这足以使承担大量5-HTP的人们处于危险之中。一本名为《 5-HTP：克服抑郁，肥胖和失眠的自然方法》的书建议每天服用300至900毫克的补充剂，梅奥诊所的研究人员说，这种剂量很容易引起麻烦。如果您服用5-HTP，请保持小剂量服用，如果发现任何EMS迹象，包括疲劳，肌肉疼痛，麻木和刺痛，请咨询医生。
即使您碰巧得到了纯净的5-HTP批次，补品的效果也可能并不总是良性的。根据神经学档案馆的一项研究，用户可能变得躁狂，躁动，烦躁和沮丧（尽管这种情况较不常见）。这就是更多谨慎使用5-HTP或避免使用它的原因。怀孕或哺乳的妇女应完全避免补充。
